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蛋白结构预测-同源建模
蛋白结构预测-同源建模
蛋白结构预测-同源建模
2024/10/23
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▲ 蛋白结构预测技术原理图
同源建模(Homology Modeling)是指根据模板蛋白将一级序列转成 3D 结构。我们在获得蛋白质的序列后,可通过与同源蛋白的结构比对预测目标蛋白的三级结构。对于尚未或者无法获得实验晶体结构的蛋白质，同源建模无疑是一种重要而有效的辅助手段。
通过AlphaFold 2或Swiss-model进行同源建模，预测蛋白3D结构。
序列搜索和比对，获得同源蛋白质序列和结构
结构比对，构建目标蛋白三维结构
利用分子动力学模拟等方法进行结构优化
